请让我无耻的抛砖引源吧：
JASPAR –http://jaspar.cgb.ki.se 收集有关转录因子与 DNA 结合位点模体 (motif) 的最全面的公开的数据库
ITFP –http://itfp.biosino.org/itfp
ConSite –
TRANSFAC –http://www.gene-regulation.com
rVista2.0 –
Weblog –
PISCES –
CH-HIT –
PSIPRED –
ChEMBL –
David –
Omiga –
DNASIS –
DNATools –
PCgene –
DNAssist – 限制酶切位点分析
Primer Premier – 引物设计
GeneDoc – 序列的同源比较
Clustal X – 对核酸与蛋白序列进行多序列比较
Gene Construction Kit – 质粒构建
RNAStructure --RNA 二级结构预测
Antheprot – 蛋白二级结构分析
RasMol – 三维结构显示
Cn3D – ncbi.nlm.nih.gov/Structure/CN3D/cn3dunix-4.1.shtml 蛋白质三维结构分析
Seqverter – 格式转换
band leader – 电泳图谱分析
molmol – 将 pdb 等格式的蛋白文件通过转换，存成普通的图形文件
Sequin – 向 GenBank、EMBL、DDBJ 三大核酸序列库递交序列
Redsoft Plasmid – 快速和轻松地生成一个清晰，色彩鲜明的环行或线性的载体图
PC-Rare – 应用八聚体频率出现的不一致性的方法（OFD）来设计 PCR 的引物